RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 ARCQ7LC44 396 aa26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 IQCDQ96DY2 449 aa26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 ELOVL2Q9NXB9 296 aa26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 GGA2Q9UJY4 613 aa26.02■■□□□ 1.76
PDF-201ENST00000288022 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 KRT3P12035 628 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SKILP12757 684 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CNR2P34972 360 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PRKCIP41743 596 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CXCR3P49682 368 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ATP11AP98196 1134 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CDH18Q13634 790 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 BRMS1LQ5PSV4 323 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CEP68Q76N32 757 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CHST9Q7L1S5 443 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 JOSD2Q8TAC2 188 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 WFDC5Q8TCV5 224 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RXFP2Q8WXD0 754 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SYT11Q9BT88 431 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TKTL2Q9H0I9 626 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SIK2Q9H0K1 926 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 EPC1Q9H2F5 836 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TMEM51Q9NW97 253 aa26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 H0Y626 953 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HRO43593 1189 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PAGE1O75459 146 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PDGFRAP16234 1089 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SDC4P31431 198 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RDXP35241 583 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CDO1Q16878 200 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RABGAP1LQ5R372 815 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 DNAJC24Q6P3W2 148 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 AHI1Q8N157 1196 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 C3orf20Q8ND61 904 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ERLEC1Q96DZ1 483 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TPSD1Q9BZJ3 242 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 EBF1Q9UH73 591 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RAB23Q9ULC3 237 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HS3ST4Q9Y661 456 aa26■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TIMM44O43615 452 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ADCY5O95622 1261 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CD70P32970 193 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 GGCXP38435 758 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ZBED6P86452 979 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 E2F5Q15329 346 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TMEM215Q68D42 235 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RNF43Q68DV7 783 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 PGBD3Q8N328 593 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 FIBINQ8TAL6 211 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HMGB4Q8WW32 186 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TAS2R14Q9NYV8 317 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.752e-10■■■□□ 14.7
PDF-201ENST00000288022 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.99■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ANKRD62A6NC57 917 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 WASH3PC4AMC7 463 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 LPAL2Q16609 132 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 FBXL22Q6P050 247 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 FAM131BQ86XD5 332 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 GAB3Q8WWW8 586 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 HINFPQ9BQA5 517 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 RAD54BQ9Y620 910 aa25.98■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.97■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.97■■□□□ 1.75
PDF-201ENST00000288022 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms