RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 WBP1LQ9NX94 342 aa15.05■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 PIAS1O75925 651 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 GLUD2P49448 558 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 NPWQ8N729 165 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 SERPINB11Q96P15 392 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 NCAM2O15394 837 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 KRT15P19012 456 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 SEC24CP53992 1094 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CFAP36Q96G28 342 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 HAPLN3Q96S86 360 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 FAM107BQ9H098 131 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RASA4BC9J798 803 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RASA4O43374 803 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 OPHN1O60890 802 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CREB1P16220 341 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MX2P20592 715 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 FDFT1P37268 417 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 EFEMP1Q12805 493 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 GIPC2Q8TF65 315 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TBX21Q9UL17 535 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 NDUFAB1O14561 156 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CLTBP09497 229 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 BRAFP15056 766 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 SMARCB1Q12824 385 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TAF10Q12962 218 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 USP41Q3LFD5 358 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 ZNF567Q8N184 647 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MGARPQ8TDB4 240 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 EPN3Q9H201 632 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 RAD54BQ9Y620 910 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.03■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TBX18O95935 607 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 OR1D2P34982 312 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 WASHC5Q12768 1159 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 SEMA5AQ13591 1074 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -04e-7■■■■□ 26.7
NICN1-201ENST00000273598 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MIB1Q86YT6 1006 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 MCUQ8NE86 351 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 ZNF333Q96JL9 665 aa15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NICN1-201ENST00000273598 TMEM120BA0PK00 339 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 DFFAO00273 331 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 CPP00450 1065 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 TPSB2P20231 275 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 PSMB4P28070 264 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 GCAP28676 217 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 GRIA1P42261 906 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 MAGEA6P43360 314 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 TBX4P57082 545 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 PPP2R5DQ14738 602 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 TPSAB1Q15661 275 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 NUP205Q92621 2012 aa15.02□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 ADAM12O43184 909 aa15.01□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 TBC1D4O60343 1298 aa15.01□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 MSH2P43246 934 aa15.01□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 PSMD5Q16401 504 aa15.01□□□□□ -0.01
NICN1-201ENST00000273598 PARP6Q2NL67 630 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms