RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CDC73Q6P1J9 531 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SYT12Q8IV01 421 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 Q8NA96 180 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 MZB1Q8WU39 189 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 C5orf34Q96MH7 638 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NEU1Q99519 415 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 APOL6Q9BWW8 343 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 EPC1Q9H2F5 836 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 KAT14Q9H8E8 782 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 THAP1Q9NVV9 213 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.44□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 GLOD5A6NK44 160 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 E7ENX8 843 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ARSAP15289 507 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ITGALP20701 1170 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 AVPR2P30518 371 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TTKP33981 857 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CDH8P55286 799 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TAS2R50P59544 299 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TMF1P82094 1093 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TAP2Q03519 686 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SEMA3BQ13214 749 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CRYMQ14894 314 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 LY6KQ17RY6 165 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ZNF605Q86T29 641 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NUP93Q8N1F7 819 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 FAR2Q96K12 515 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TCF25Q9BQ70 676 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CDH22Q9UJ99 828 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 PER2O15055 1255 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 C1SP09871 688 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 MCM3P25205 808 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 HNF1BP35680 557 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 HNF4AP41235 474 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CPA2P48052 419 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 PCP4P48539 62 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 IRAK1P51617 712 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SP2Q02086 613 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TLE3Q04726 772 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CDK18Q07002 472 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 ABHD18Q0P651 414 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 E2F5Q15329 346 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NTRK2Q16620 822 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 NBPF11Q86T75 865 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM2-201ENST00000258148 SYNE4Q8N205 404 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms