RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MYL12AP19105 171 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MGAT5Q09328 741 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 RNF145Q96MT1 663 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 COQ7Q99807 217 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 BTN3A1O00481 513 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FCGR1AP12314 374 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 ALOX12P18054 663 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TERB1Q8NA31 727 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 POMKQ9H5K3 350 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 NTSR2O95665 410 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 OMA1Q96E52 524 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 VPS51Q9UID3 782 aa20.89■□□□□ 0.94
ZBED3-201ENST00000255198 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 MAPKAPK2P49137 400 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PTSQ03393 145 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GANQ9H2C0 597 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 MICAL2O94851 1124 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 NPY2RP49146 381 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 NDST1P52848 882 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ATP9AO75110 1047 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PRKAG1P54619 331 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 BIKQ13323 160 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GRIK4Q16099 956 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 EML3Q32P44 896 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TATDN2Q93075 761 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CYLDQ9NQC7 956 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PTGES3LE9PB15 166 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GHRP10912 638 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 APBA2Q99767 749 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CTDNEP1O95476 244 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 AMPD1P23109 780 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CTSEP14091 401 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PLK1P53350 603 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 BACE1P56817 501 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CDC73Q6P1J9 531 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 IFNA16P05015 189 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 IGSF6O95976 241 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC130P13994 396 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 GRTP1Q5TC63 336 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 DHFR2Q86XF0 187 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 KYQ8NBH2 561 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 FANCEQ9HB96 536 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 CROTQ9UKG9 612 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PIK3CDO00329 1044 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 RAG1P15918 1043 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 AHI1Q8N157 1196 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 TMC2Q8TDI7 906 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 MROH8Q9H579 483 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 VPS45Q9NRW7 570 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED3-201ENST00000255198 PROSCO94903 275 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms