RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd12Q6WVG3 327 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr392Q7TRX6 312 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kirrel2Q7TSU7 700 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim14Q8BVW3 440 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dedd2Q8QZV0 330 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lman1lQ8VCD3 505 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itgbl1Q8VDV0 494 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx15Q91WE1 337 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lpin1Q91ZP3 924 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas1r3Q925D8 858 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsph3bQ9DA80 389 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fut2Q9JL27 347 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iigp1Q9QZ85 413 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbck1Q9WUB0 508 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A0A1Y7VP24 259 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pramef17A2ASJ1 475 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2310061I04RikB8JJ69 315 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm44503E9PYU5 387 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6205E9PZS2 359 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad51ap2G3UW63 976 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AmacrO09174 381 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magea1O89006 320 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChrngP04760 519 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnmt3cP0DOY1 709 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd3gP11942 182 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtpraP18052 829 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clcn3P51791 818 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irf3P70671 419 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Meaf6Q2VPQ9 191 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Faf2Q3TDN2 445 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyrfQ3UR85 1138 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Heatr9Q5QNV8 569 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sv2cQ69ZS6 727 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbtd1Q6P5G3 631 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc154Q6RUT8 657 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr91Q7TMQ7 748 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Moxd2Q7TT41 619 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Catsper3Q80W99 395 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1lQ8BHN0 360 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsdl1Q8BTX9 330 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6367Q8C6L9 287 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Upb1Q8VC97 393 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Catsper1Q91ZR5 686 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FdpsQ920E5 353 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PmpcbQ9CXT8 489 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fndc8Q9D2H8 321 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700123K08RikQ9D991 295 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc86Q9JJ89 426 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmod2Q9JKK7 351 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tagln3Q9R1Q8 199 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magea2Q9R2A2 320 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem115Q9WUH1 350 aa6.78□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp236S4R299 1847 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21731A0A286YDE9 180 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map7d3A2AEY4 876 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UprtB1AVZ0 310 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr731F8VQB9 326 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Timm44O35857 452 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klrk1O54709 232 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IkbkgO88522 412 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfy2P20662 777 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PfkmP47857 780 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CstaP56567 97 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clhc1Q5M6W3 596 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DgkqQ6P5E8 934 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fads6Q80UG1 342 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Baiap2l2Q80Y61 522 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap15Q811M1 481 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SowahaQ8BLS7 548 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep57Q8CEE0 500 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc36a1Q8K4D3 475 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb10Q91VE5 797 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GatbQ99JT1 557 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krcc1Q99JT5 256 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Haus8Q99L00 373 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mov10l1Q99MV5 1187 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ogfod2Q9CQ04 349 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ProzQ9CQW3 399 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox16Q9CR63 106 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CygbQ9CX80 190 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ing2Q9ESK4 281 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms