RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnf145Q5SWK7 663 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bcar1Q61140 874 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wee2Q66JT0 555 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ubxn7Q6P5G6 467 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cspg5Q71M36 566 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abcg2Q7TMS5 657 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sgo2Q7TSY8 1164 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SpidrQ8BGX7 933 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Btnl9Q8BJE2 536 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pde2aQ922S4 916 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kremen1Q99N43 473 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tssc4Q9JHE7 317 aa9.53□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pds5aQ6A026 1332 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf804aA2AKY4 1200 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm5930D3Z257 264 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2c39P56656 490 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rps7P62082 194 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 1700061G19RikQ08EE8 705 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mks1Q5SW45 561 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klra3Q64329 266 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpr139Q80UC8 345 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Samd4bQ80XS6 687 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hspa13Q8BM72 471 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GmppbQ8BTZ7 360 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abi3Q8BYZ1 367 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl12Q8BZM0 568 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Adam32Q8K410 754 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcdhga4Q91XY4 930 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slfn14V9GXG1 899 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pnpla7A2AJ88 1352 aa9.52□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smok3aC0HKC8 504 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smok3bC0HKC9 504 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tnk2O54967 1055 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Asna1O54984 348 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rdh7O88451 316 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vps26aP40336 327 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 VwdeQ6DFV8 926 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mib1Q80SY4 1006 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmcc2Q80W04 706 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tex13c3Q810P0 219 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rftn2Q8CHX7 500 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GhdcQ99J23 532 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clvs1Q9D4C9 354 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PgdQ9DCD0 483 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RhoaQ9QUI0 193 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Map3k6Q9WTR2 1291 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm10406A6NAS4 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3373A6NAS7 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3252E9PUT9 216 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3002E9PW72 216 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3298E9PW80 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3468E9QAJ8 216 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3667K7N757 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cd151O35566 253 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mmp14P53690 582 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrpap1P55302 360 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ugt1a2P70691 533 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp217Q3U0X6 1041 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BC030870Q3V2G4 71 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3558Q5FWC9 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ugt1a1Q63886 535 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zbtb44Q8R0A2 453 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TraipQ8VIG6 470 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnft1Q9DCN7 395 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp21Q9QZL6 566 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Htr3aP23979 487 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 B3gat3P58158 335 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ak8Q32M07 479 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Plekhf1Q3TB82 279 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Shroom1Q5SX79 823 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Txndc8Q69AB2 127 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Antxr2Q6DFX2 487 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TbcdQ8BYA0 1196 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Il31raQ8K5B1 716 aa9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prrg1A2BFE8 218 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Emilin3P59900 758 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tsc22d1P62500 1077 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pkn1P70268 946 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GclcP97494 637 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pnma2Q8BHK0 365 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam180aQ8BR21 173 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cops7bQ8BV13 264 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Angel1Q8VCU0 667 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mzt2Q9CQ25 159 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Actrt1Q9D9J3 376 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bscl2Q9Z2E9 383 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Magea10A2AMW4 325 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Unc5cO08747 931 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 EpoP07321 192 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf280dQ68FE8 974 aa9.51□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mfn2Q80U63 757 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms