RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 UBA3Q8TBC4 463 aa23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 KAT5Q92993 513 aa23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ITPR1Q14643 2758 aa23.01■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 MEI4A8MW99 385 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 GABBR2O75899 941 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 LATS1O95835 1130 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CYBBP04839 570 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ZNF445P59923 1031 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CETN1Q12798 172 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 GEN1Q17RS7 908 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PNPLA1Q8N8W4 532 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CD93Q9NPY3 652 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ABCC13Q9NSE7 274 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 RAD54BQ9Y620 910 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 A0A1B0GTW7 788 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 GNA14O95837 355 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CD6P30203 668 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PAK1Q13153 545 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CNGA2Q16280 664 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 IRGQQ8WZA9 623 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 M0QYV0 167 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CBFA2T3O75081 653 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 STARD3Q14849 445 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 PMF1Q6P1K2 205 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 RNF139Q8WU17 664 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 EDEM1Q92611 657 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 LAMA5O15230 3695 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ACACAQ13085 2346 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 WASH3PC4AMC7 463 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 CER1O95813 267 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 IGLV3-27P01718 113 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ZNF883P0CG24 379 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 IL12RB1P42701 662 aa22.97■■□□□ 1.27
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SRRT-218ENST00000620394 E2F5Q15329 346 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 MPPE1Q53F39 396 aa22.97■■□□□ 1.27
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SRRT-218ENST00000620394 MDM1Q8TC05 714 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 UCMAQ8WVF2 138 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 HSFY1Q96LI6 401 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 BIN1O00499 593 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 LCP1P13796 627 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 MAOBP27338 520 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 FUT11Q495W5 492 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 RRAGAQ7L523 313 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 DDI1Q8WTU0 396 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 DKK4Q9UBT3 224 aa22.96■■□□□ 1.27
SRRT-218ENST00000620394 FBXO21O94952 628 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 APC2O95996 2303 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 NCAM1P13591 858 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 RGS7P49802 495 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 STX17P56962 302 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 ZNF234Q14588 700 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 MEA1Q16626 185 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 ADGRF1Q5T601 910 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TMEM215Q68D42 235 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.95■■□□□ 1.26
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