RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	ACSS2	Q9NR19	701 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CNTN3	Q9P232	1028 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TXNDC9	O14530	226 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FKBP6	O75344	327 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ITGA2B	P08514	1039 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SAT1	P21673	171 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	GTF2A2	P52657	109 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LPCAT4	Q643R3	524 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FZD8	Q9H461	694 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CCDC78	A2IDD5	438 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	AQP4	P55087	323 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ASPH	Q12797	758 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	ACAP1	Q15027	740 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	PPM1J	Q5JR12	505 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	FAM131B	Q86XD5	332 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	S100A14	Q9HCY8	104 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SMTN-223	ENST00000619644	NFKBIE	O00221	500 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	IL1B	P01584	269 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	BPGM	P07738	259 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	INSRR	P14616	1297 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	UQCRB	P14927	111 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SERPINB6	P35237	376 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GRM2	Q14416	872 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PDK2	Q15119	407 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SULF1	Q8IWU6	871 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	HACE1	Q8IYU2	909 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	C12orf42	Q96LP6	360 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TPP1	O14773	563 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TSHR	P16473	764 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DLG1	Q12959	904 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	LBX2	Q6XYB7	198 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ATP2A3	Q93084	1043 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	HES2	Q9Y543	173 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PGM3	O95394	542 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MGAT1	P26572	445 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RBP5	P82980	135 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	OLIG2	Q13516	323 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	VGLL4	Q14135	290 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	HIC1	Q14526	733 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PNPO	Q9NVS9	261 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TRIP11	Q15643	1979 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PPEF2	O14830	753 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PFDN1	O60925	122 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	USP12	O75317	370 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TGM2	P21980	687 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TYK2	P29597	1187 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MLH1	P40692	756 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC1A6	P48664	564 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ILDR2	Q71H61	639 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TTC30A	Q86WT1	665 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	C7orf26	Q96N11	449 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF358	Q9NW07	568 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644		A0A088AWK7	358 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ATP9B	O43861	1147 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TMCC1	O94876	653 aa		14.88	□□□□□ -0.03

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