RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 HECTD3Q5T447 861 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS33Q8NF86 280 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZIM3Q96PE6 472 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 COX16Q9P0S2 106 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 H0YHG0 523 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM153BP0C7A2 387 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SARNPP82979 210 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM153CQ494X1 144 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM3CQ92520 227 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR88Q9GZN0 384 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 EPB41L5Q9HCM4 733 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GCNT1Q02742 428 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC18A3Q16572 532 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PACS2Q86VP3 889 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CAVIN3Q969G5 261 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 NXPE3Q969Y0 559 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 P2RY11Q96G91 374 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT12Q99456 494 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM83CQ9BQN1 747 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 KNL1Q8NG31 2342 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP250Q9BV73 2442 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 VDRP11473 427 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CTHP32929 405 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP1A2P50993 1020 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 MFAP3P55082 362 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC13P55735 322 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL30Q0D2K2 578 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PDCLQ13371 301 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF77Q15935 545 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT20Q8IY31 132 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PJA1Q8NG27 643 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GFPT2O94808 682 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 AOC1P19801 751 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF8P28908 595 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ABL2P42684 1182 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A11P48066 632 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CD151P48509 253 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ENPEPQ07075 957 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TRADDQ15628 312 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ALS2CLQ60I27 953 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf40Q86WS4 652 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLPH3Q9H4A6 298 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CHADO15335 359 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 P4HA2O15460 535 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF19O95750 216 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBED1O96006 694 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNAR2P48551 515 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 BCAT1P54687 386 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TCF15Q12870 199 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 RUNX3Q13761 415 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS6Q14393 721 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 E5RJQ4 531 aa13.02□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 EBAG9O00559 213 aa13.02□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 UCHL3P15374 230 aa13.02□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF132P52740 706 aa13.02□□□□□ -0.32
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC8A3P57103 927 aa13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms