RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591600.1

APOC4-201, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOC4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-201ENST00000591600 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GLRX5Q86SX6 157 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 OR2T3Q8NH03 318 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 UBA3Q8TBC4 463 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 IRGQQ8WZA9 623 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 EDEM1Q92611 657 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 AZIN2Q96A70 460 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FBRSQ9HAH7 460 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.01■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SPEGQ15772 3267 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 IGLV3-27P01718 113 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FMO5P49326 533 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ZBTB16Q05516 673 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 RING1Q06587 406 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CNGA2Q16280 664 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 DBX2Q6ZNG2 339 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 NAXDQ8IW45 347 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 AHI1Q8N157 1196 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TIGD1Q96MW7 591 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 IRAK2O43187 625 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TSPAN3O60637 253 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CBFA2T3O75081 653 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GABBR2O75899 941 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CER1O95813 267 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CAPNS1P04632 268 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 STILQ15468 1287 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PTPRNQ16849 979 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PMF1Q6P1K2 205 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CHST9Q7L1S5 443 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TFAP2BQ92481 460 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SMARCE1Q969G3 411 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 HSFY1Q96LI6 401 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GGA2Q9UJY4 613 aa15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 P4HA2O15460 535 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 HLA-EP13747 358 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PPP1R2P41236 205 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 LRMPQ12912 555 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 TMEM270Q6UE05 265 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 LMO3Q8TAP4 145 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CEP63Q96MT8 703 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 NT5C1BQ96P26 610 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 LHX5Q9H2C1 402 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GAREM1Q9H706 876 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.98■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 PSMA7O14818 248 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 LTFP02788 710 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 LCP1P13796 627 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 ACSL1P33121 698 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 MATKP42679 507 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 SLC11A2P49281 568 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 BNC1Q01954 994 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 CETN1Q12798 172 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 STIM1Q13586 685 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 HLA-BQ31612 363 aa15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
APOC4-201ENST00000591600 MBLAC2Q68D91 279 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms