RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589201.1

LINC00654-202, long intergenic non-protein coding RNA 654, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00654, Length 579 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00654-202ENST00000589201 TBL1XO60907 577 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MMP8P22894 467 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SCNN1AP37088 669 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 NME3Q13232 169 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 EBF1Q9UH73 591 aa20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 M0QYT0 321 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 FERP16591 822 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 HLA-FP30511 346 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 NTSR1P30989 418 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CCR1P32246 355 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 LPAL2Q16609 132 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MPP7Q5T2T1 576 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TMEM215Q68D42 235 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ANO7Q6IWH7 933 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CHPFQ8IZ52 775 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RNF34Q969K3 372 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 NPY6RQ99463 290 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 AGPAT1Q99943 283 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 STIM2Q9P246 746 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MYO6Q9UM54 1294 aa20.6■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 WASH3PC4AMC7 463 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SLC2A3P11169 496 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 UBASH3AP57075 661 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RNF43Q68DV7 783 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 GAB3Q8WWW8 586 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 NT5C3BQ969T7 300 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RRN3Q9NYV6 651 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 EML5Q05BV3 1969 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 FAM186AA6NE01 2351 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 LRRC53A6NM62 1247 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CCDC172P0C7W6 258 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 HOXB2P14652 356 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ABCB4P21439 1286 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TACR2P21452 398 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 FLT3P36888 993 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SULT1E1P49888 294 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PTP4A2Q12974 167 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 NFKBIBQ15653 356 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SDE2Q6IQ49 451 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TRNP1Q6NT89 227 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CEP68Q76N32 757 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 RASSF3Q86WH2 238 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 CHSY1Q86X52 802 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 LGI2Q8N0V4 545 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 DCLK2Q8N568 766 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 PIGVQ9NUD9 493 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00654-202ENST00000589201 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 A0A1W2PQF6 199 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 TIMM44O43615 452 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 ALDH1A2O94788 518 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 CENPCQ03188 943 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 UCMAQ8WVF2 138 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 RUBCNQ92622 972 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00654-202ENST00000589201 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms