RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM121Q9BTD3 319 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 RTP4Q96DX8 246 aa26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIF1AQ16665 826 aa26.33■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 PEBP4Q96S96 227 aa26.33■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRNP1Q6NT89 227 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 VSTM1Q6UX27 236 aa26.32■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 SGSM3Q96HU1 749 aa26.32■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 A8MXQ7 604 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 IFNB1P01574 187 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL6Q8N531 539 aa26.3■■□□□ 1.8
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