RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 DAOAP59103 153 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC63Q05C16 580 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 LRMPQ12912 555 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 FAM124AQ86V42 546 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 SCML4Q8N228 414 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAF4-216ENST00000586813 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 LHX5Q9H2C1 402 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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TRAF4-216ENST00000586813 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 PSMA7O14818 248 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 PMM2O15305 246 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 IRAK2O43187 625 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 TBL1XO60907 577 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 LTFP02788 710 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 SLC6A4P31645 630 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF4-216ENST00000586813 CD70P32970 193 aa20.13■□□□□ 0.81
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