RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PENKP01210 267 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A13Q5J8X5 152 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3R6Q5UE93 754 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FYB2Q5VWT5 728 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM7Q9C029 511 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIA3Q5JRA6 1907 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPRD1P41143 372 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB6CQ53S08 254 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFWD3Q6PCD5 774 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM139Q8IV31 216 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDI1Q8WTU0 396 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD101Q93033 1021 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 BHMTQ93088 406 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY13Q9BPV8 354 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB6CQ9H0N0 254 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTUQ9ULD6 942 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNG3O60359 315 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAGE1O75459 146 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBXN2BQ14CS0 331 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PON2Q15165 354 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP1GAP2Q684P5 730 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf40Q86WS4 652 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHSY1Q86X52 802 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXQ1Q9C009 403 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANLNQ9NQW6 1124 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLK2Q9NYY3 685 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 UVRAGQ9P2Y5 699 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM86C2PA6NEL3 165 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN3O60637 253 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA10O95299 355 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPA17Q15506 151 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL13BQ3SXY8 428 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PJA1Q8NG27 643 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY11Q96G91 374 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSBPL6Q9BZF3 934 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 I6L893 689 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TACR2P21452 398 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALK1P51570 392 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSE1Q14687 1217 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPP7Q5T2T1 576 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT16Q8N8M0 369 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAPLN3Q96S86 360 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANAPC7Q9UJX3 599 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS3ST4Q9Y661 456 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 F5H5T6 163 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF8O76064 485 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TARSP26639 723 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAP1Q15027 740 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM196Q5HYL7 178 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD9BQ6WBX8 426 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM170BA6NMN3 283 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR33A8MZF0 331 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TULP3O75386 442 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA1P43355 309 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM31Q5JXX7 168 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGI2Q8N0V4 545 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF687Q8N1G0 1237 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL6Q8N531 539 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTAN1Q96AB6 310 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEC1Q9P2X7 70 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIT1Q9Y3P8 196 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A11P48066 632 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGSHP51688 502 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCN5P51795 746 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf74Q96LT6 269 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNKPQ96T60 521 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIK2Q9H0K1 926 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
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