RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFHBQ8N7U6 833 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACTL9Q8TC94 416 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 P3H4Q92791 437 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAPLN3Q96S86 360 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPAS1Q99814 870 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL21Q9HBE4 155 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 STIM2Q9P246 746 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.83■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 DYNC1I1O14576 645 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYL4P12829 197 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HYAL1Q12794 435 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PQLC3Q8N755 202 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 VN1R2Q8NFZ6 395 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAF2Q96CS3 445 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC39A13Q96H72 371 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNKPQ96T60 521 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC3Q9BY71 257 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIDD1Q9HB75 910 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.82■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf78A6NCI8 922 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 COCHO43405 550 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 LIASO43766 372 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TGM2P21980 687 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 GUCY2DQ02846 1103 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC9A4Q6AI14 798 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHDC10Q6PID8 442 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFX8Q6ZV50 586 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAREM2Q75VX8 874 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM150AQ86TG1 271 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLD5Q8N7P1 536 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATL2Q8NHH9 583 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRK7Q8WTQ7 553 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSBPL2Q9H1P3 480 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATXN3LQ9H3M9 355 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ECEL1O95672 775 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHOP08100 348 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPHA5P54756 1037 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R7Q15435 360 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 JAMLQ86YT9 394 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM187AA6NFU0 413 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCF2LO15068 1137 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRIG2O94898 1065 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCM3P25205 808 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPHB2P29323 1055 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 COG7P83436 770 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP4F8P98187 520 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMNB2Q03252 620 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEMA3BQ13214 749 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTN2A3PQ96KV6 586 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF38Q9H0F5 515 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ETNK2Q9NVF9 386 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HS3ST4Q9Y661 456 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTCH2Q9Y6C9 303 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRU2 124 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K6O95382 1288 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFBP4P22692 258 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGIRP43119 386 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HCAR3P49019 387 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 RING1Q06587 406 aa17.79■□□□□ 0.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUGGCQ68CJ6 796 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms