RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	PAGE1	O75459	146 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	APOE	P02649	317 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ERCC2	P18074	760 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	BMPR1A	P36894	532 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	GDF10	P55107	478 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PLD1	Q13393	1074 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SLMAP	Q14BN4	828 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RTP4	Q96DX8	246 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TLR5	O60602	858 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	LRIG2	O94898	1065 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	EPHB2	P29323	1055 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CA8	P35219	290 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SERPINB6	P35237	376 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PPP3CC	P48454	512 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	EPHB3	P54753	998 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PDK1	Q15118	436 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CFAP58	Q5T655	872 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	C4orf22	Q6V702	233 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	C1orf74	Q96LT6	269 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	OLFM3	Q96PB7	478 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	OGFR	Q9NZT2	677 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SMAP	O00193	183 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TP73	O15350	636 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	NCAM2	O15394	837 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	KCNN4	O15554	427 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MFSD11	O43934	449 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ETS1	P14921	441 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CTNNB1	P35222	781 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RING1	Q06587	406 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MORF4L2	Q15014	288 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SIK2	Q9H0K1	926 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	USP29	Q9HBJ7	922 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	PAK5	Q9P286	719 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CXCL14	O95715	111 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ADH1A	P07327	375 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RBL1	P28749	1068 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	RUFY1	Q96T51	708 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	IRAK3	Q9Y616	596 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MAP3K6	O95382	1288 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TBX18	O95935	607 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MX2	P20592	715 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HOXC13	P31276	330 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HSD17B3	P37058	310 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TUB	P50607	506 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	TWF1	Q12792	350 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEG3-227	ENST00000556736	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.78	■□□□□ 0.6

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