RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SDCBP2	Q9H190	292 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	LHX5	Q9H2C1	402 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NMUR1	Q9HB89	426 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SGK2	Q9HBY8	427 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CAPN8	A6NHC0	703 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	YKT6	O15498	198 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	VNN1	O95497	513 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DNTT	P04053	509 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ASPA	P45381	313 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GCLM	P48507	274 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BCAT1	P54687	386 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SLC8A3	P57103	927 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TYRO3	Q06418	890 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TTI2	Q6NXR4	508 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SCD5	Q86SK9	330 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DENND1C	Q8IV53	801 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DDI1	Q8WTU0	396 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SNX19	Q92543	992 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	COL26A1	Q96A83	441 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NXPE2	Q96DL1	559 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MED15	Q96RN5	788 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DMAC2	Q9NW81	257 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SUN2	Q9UH99	717 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SCML1	Q9UN30	329 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS20	P59510	1910 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PI4KA	P42356	2102 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CAPN9	O14815	690 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MDM4	O15151	490 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CETN3	O15182	167 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	VILL	O15195	856 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MAPK13	O15264	365 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TSPAN3	O60637	253 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SEMA4F	O95754	770 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	LATS1	O95835	1130 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KRT13	P13646	458 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	JUP	P14923	745 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PRKCH	P24723	683 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ACSL1	P33121	698 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PIK3CA	P42336	1068 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CTSK	P43235	329 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	VAMP7	P51809	220 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C21orf59	P57076	290 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ENPEP	Q07075	957 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PPP3CA	Q08209	521 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	EFEMP1	Q12805	493 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GSE1	Q14687	1217 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	STX1A	Q16623	288 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		7.15	□□□□□ -1.26

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