RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MGAT4DA6NG13 374 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FAM228BP0C875 321 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 UQCRBP14927 111 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HPCAL1P37235 193 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GUCY1A3Q02108 690 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM159Q96B96 161 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LACTBL1A8MY62 500 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 F5H423 210 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 USP1O94782 785 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CPA3P15088 417 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLC29A2Q14542 456 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 USP49Q70CQ1 688 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TMC7Q7Z402 723 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 APOPT1Q96IL0 206 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SETD4Q9NVD3 440 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SUFUQ9UMX1 484 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 B2RBV5 119 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEC1O60732 1142 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LTFP02788 710 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CCNG1P51959 295 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KDSRQ06136 332 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 XRCC4Q13426 336 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CDK20Q8IZL9 346 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 WNT8BQ93098 351 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINB3P29508 390 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 BCL2L1Q07817 233 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 EPS8Q12929 822 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 IRGQQ8WZA9 623 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf60Q96EN9 201 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 OSMRQ99650 979 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 IL22Q9GZX6 179 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RRAGCQ9HB90 399 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GPAMQ9HCL2 828 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RPTORQ8N122 1335 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KLC1Q07866 573 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RGMBQ6NW40 437 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PPTC7Q8NI37 304 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ERP27Q96DN0 273 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 UBXN8O00124 270 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DDHD2O94830 711 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CDC25CP30307 473 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PCID2Q5JVF3 399 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RGS14O43566 566 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL41O60662 606 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF670Q9BS34 389 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms