RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 SLC2A3P11169 496 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GBP1P32455 592 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PRKCIP41743 596 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 FNTBP49356 437 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SGSHP51688 502 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ENPP2Q13822 863 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CRY1Q16526 586 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TRNP1Q6NT89 227 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 RASSF3Q86WH2 238 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ALLCQ8N6M5 410 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DDI1Q8WTU0 396 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 BHMTQ93088 406 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SGK1O00141 431 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 HRO43593 1189 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TSPAN3O60637 253 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 ENDOD1O94919 500 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TIE1P35590 1138 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CXCR3P49682 368 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 UBASH3AP57075 661 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 MTA1Q13330 715 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 GEN1Q17RS7 908 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 C2CD6Q53TS8 623 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 DDIT4Q9NX09 232 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-211ENST00000534401 A0A1W2PQJ5 194 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 LRRC53A6NM62 1247 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 APBB3O95704 486 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 APOEP02649 317 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 CCR1P32246 355 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 FLT3P36888 993 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 DGKEP52429 567 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ARID5AQ03989 594 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 EOGTQ5NDL2 527 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TMEM215Q68D42 235 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 GABRG3Q99928 467 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 NUP58Q9BVL2 599 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 NPC1O15118 1278 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TIMM44O43615 452 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 F9P00740 461 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 HLA-FP30511 346 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 NTSR1P30989 418 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 C5orf22Q49AR2 442 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 MON1BQ7L1V2 547 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 FIBINQ8TAL6 211 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 HHIPQ96QV1 700 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 PIGVQ9NUD9 493 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 CKAP5Q14008 2032 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 M0QYT0 321 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TACR2P21452 398 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ARTNQ5T4W7 220 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 IQCDQ96DY2 449 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 ACOX2Q99424 681 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TSPY26PQ9H489 355 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 A0A1W2PQF6 199 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 I6L893 689 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 AXIN1O15169 862 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 GFRA3O60609 400 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 TBL1XO60907 577 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-211ENST00000534401 C7P10643 843 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms