RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 LRCH4O75427 683 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 MAP3K7CLP57077 242 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SLC34A1Q06495 639 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CDO1Q16878 200 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM110Q86TL2 294 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PIGZQ86VD9 579 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 MED10Q9BTT4 135 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 VCX3BQ9H321 246 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 KRT82Q9NSB4 513 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TBX21Q9UL17 535 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZWINTO95229 277 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 GJA8P48165 433 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 BCAT1P54687 386 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PDK4Q16654 411 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ARMC5Q96C12 935 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 GBP5Q96PP8 586 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 RASA4BC9J798 803 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 RASA4O43374 803 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PTPN7P35236 360 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 AP1B1Q10567 949 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 STILQ15468 1287 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZWILCHQ9H900 591 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 VWA8A3KMH1 1905 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 M0QZQ0 153 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 C2CD2LO14523 706 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC22O60826 627 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ABHD2P08910 425 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ODC1P11926 461 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 DNAJC3Q13217 504 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 STKLD1Q8NE28 680 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 MAML1Q92585 1016 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SMOQ99835 787 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ADIGQ0VDE8 80 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ALLCQ8N6M5 410 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 AZIN2Q96A70 460 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 C9orf72Q96LT7 481 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PEBP4Q96S96 227 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 DUSP16Q9BY84 665 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SENP1Q9P0U3 644 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TBK1Q9UHD2 729 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CBX6O95503 412 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CXCL10P02778 98 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CDKN2BP42772 138 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 LHX1P48742 406 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ARSEP51690 589 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 FAM35AQ86V20 835 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 ABI1Q8IZP0 508 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PHC3Q8NDX5 983 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 URGCPQ8TCY9 931 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 NCSTNQ92542 709 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 MYLPFQ96A32 169 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 SUSD3Q96L08 255 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 CYLDQ9NQC7 956 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms