RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 METTL23Q86XA0 190 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FBF1Q8TES7 1133 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MYLPFQ96A32 169 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 USP29Q9HBJ7 922 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 C9IYK1 514 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CAPN9O14815 690 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 B4GALT3O60512 393 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TMEM63AO94886 807 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FYNP06241 537 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 USP17L7P0C7H9 530 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SKIP12755 728 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 GOT1P17174 413 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TGM2P21980 687 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 AMPD1P23109 780 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 BDNFP23560 247 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 RBL1P28749 1068 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CD151P48509 253 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 DAOAP59103 153 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 HIF1AQ16665 826 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 GALNTL6Q49A17 601 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MFSD5Q6N075 450 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CENPUQ71F23 418 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PCGF5Q86SE9 256 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ADAM32Q8TC27 787 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 NT5C3BQ969T7 300 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FAF2Q96CS3 445 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SERPINB12Q96P63 405 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TMEM209Q96SK2 561 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 NPY6RQ99463 290 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SQORQ9Y6N5 450 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ALOX15BO15296 676 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ZBED1O96006 694 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 BNIP1Q12981 228 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MSS51Q4VC12 460 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 VSIG1Q86XK7 387 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ACBD6Q9BR61 282 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 RGS18Q9NS28 235 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 PIGVQ9NUD9 493 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 TBK1Q9UHD2 729 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 HHLA1C9JL84 531 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 H0Y3Z8 333 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 M0QZQ0 153 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 NDC80O14777 642 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CAPN15O75808 1086 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 DDHD2O94830 711 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 FBXO21O94952 628 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 CYP11A1P05108 521 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 SPATA31D3P0C874 917 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 GRK4P32298 578 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 ARL4AP40617 200 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MMP13P45452 471 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 DEUP1Q05D60 604 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX6-210ENST00000528252 MPP3Q13368 585 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms