RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TROAPQ12815 778 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 RIN1Q13671 783 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PGM5Q15124 567 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 USH1GQ495M9 461 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 VPS53Q5VIR6 699 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ANO1Q5XXA6 986 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.71□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 RABGGTAQ92696 567 aa4.71□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 LCTP09848 1927 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 GJB5O95377 273 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 ALADP13716 330 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NPNTQ6UXI9 565 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 DENND1CQ8IV53 801 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 WASF1Q92558 559 aa4.7□□□□□ -1.66
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HDAC2-216ENST00000523628 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 L1RE1Q9UN81 338 aa4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.7□□□□□ -1.66
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