RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PARVBQ9HBI1 364 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC42Q9Y546 428 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SBF1O95248 1867 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CITO14578 2027 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GPR32O75388 356 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TTC4O95801 387 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH1A1P00352 501 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK1P29120 753 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CDKN2BP42772 138 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ACADSBP45954 432 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TKTL1P51854 596 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 AP1B1Q10567 949 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 COX10Q12887 443 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PTP4A2Q12974 167 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PTK6Q13882 451 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MORN1Q5T089 497 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KLC3Q6P597 504 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 UNC93AQ86WB7 457 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB106AQ8N104 65 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 STKLD1Q8NE28 680 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 EDEM1Q92611 657 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRN2Q92932 1015 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SKA1Q96BD8 255 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KLC2Q9H0B6 622 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KLF15Q9UIH9 416 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SCOCQ9UIL1 159 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PADI3Q9ULW8 664 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RLFQ13129 1914 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 NDC80O14777 642 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT4O43236 478 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 AOC2O75106 756 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 INHBAP08476 426 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CHN1P15882 459 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CA4P22748 312 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TUBP50607 506 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 NRLP54845 237 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TSPY1Q01534 308 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 NOGQ13253 232 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC142Q17RM4 750 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 EFHC2Q5JST6 749 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SPERTQ8NA61 448 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ART4Q93070 314 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 IFT43Q96FT9 208 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DDIT4Q9NX09 232 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CDH16O75309 829 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG7O75391 227 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO21O94952 628 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MSH2P43246 934 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CLCNKBP51801 687 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LSAMPQ13449 338 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TCEAL1Q15170 157 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MUM1Q2TAK8 710 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.09□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.09□□□□□ -1.11
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