RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 CHADO15335 359 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 FBXO21O94952 628 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 POMCP01189 267 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ALBP02768 609 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 AKT1P31749 480 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CCR1P32246 355 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PTGIRP43119 386 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CD151P48509 253 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 GALNTL6Q49A17 601 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SPATA17Q96L03 361 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 LGMNQ99538 433 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 A0A0A0MRY4 1105 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZNF197O14709 1029 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 NCAM2O15394 837 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TBC1D12O60347 775 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SOAT2O75908 522 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MYO1DO94832 1006 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 LGALS2P05162 132 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZNF23P17027 643 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 NNMTP40261 264 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RGS4P49798 205 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CPT1AP50416 773 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 HDAC4P56524 1084 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 LAMB3Q13751 1172 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 GRTP1Q5TC63 336 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TMC7Q7Z402 723 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MFN1Q8IWA4 741 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 DAW1Q8N136 415 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TLCD1Q96CP7 247 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CCDC126Q96EE4 140 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SPATA13Q96N96 652 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CPXM1Q96SM3 734 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SPON1Q9HCB6 807 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 C2CD2LO14523 706 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RBP1P09455 135 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 KRT33BQ14525 404 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 LENG9Q96B70 501 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ZNF333Q96JL9 665 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 FAR2Q96K12 515 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RNF112Q9ULX5 631 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RPTORQ8N122 1335 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PEX10O60683 326 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 BAIAP3O94812 1187 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 USP17L7P0C7H9 530 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ADORA2AP29274 412 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 LHX1P48742 406 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 RTP1P59025 263 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 VGLL4Q14135 290 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ARHGEF6Q15052 776 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 CCDC153Q494R4 210 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 WLSQ5T9L3 541 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 PIGZQ86VD9 579 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 TNS4Q8IZW8 715 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 GANCQ8TET4 914 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 FBXO32Q969P5 355 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.24□□□□□ -1.09
NEK1-208ENST00000512193 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms