RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497146.5

PTGER3-211, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,971 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-211ENST00000497146 FAM72BQ86X60 149 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 RNF34Q969K3 372 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 DEFB118Q96PH6 123 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 LGMNQ99538 433 aa22.24■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 RASA4O43374 803 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 VAV1P15498 845 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 FDFT1P37268 417 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 AP1B1Q10567 949 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 FBF1Q8TES7 1133 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 TNFRSF10BO14763 440 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 IGLV3-25P01717 112 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 OR4Q2P0C623 313 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 TTC3P53804 2025 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 ALDH2P05091 517 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 MX2P20592 715 aa22.22■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 MPP2Q14168 576 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.22■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 C8orf48Q96LL4 319 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 CASD1Q96PB1 797 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 CYTH2Q99418 400 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.22■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 IRAK2O43187 625 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 MTSS1O43312 755 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 KRT15P19012 456 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTGER3-211ENST00000497146 HTR7P34969 479 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 NUP93Q8N1F7 819 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 P2RY11Q96G91 374 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-211ENST00000497146 EPHB2P29323 1055 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTGER3-211ENST00000497146 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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PTGER3-211ENST00000497146 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 RNF208Q9H0X6 261 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTGER3-211ENST00000497146 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 PLXNA3P51805 1871 aa22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 GSTA2P09210 222 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MAGEA3P43357 314 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SMARCB1Q12824 385 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 QPCTQ16769 361 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MON1AQ86VX9 555 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SERPINB11Q96P15 392 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 PAFAH2Q99487 392 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.19■■□□□ 1.14
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