RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484806.1

SFI1-223, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-223	ENST00000484806	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		8.33	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RAD54B	Q9Y620	910 aa		8.33	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CPQ	Q9Y646	472 aa		8.33	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806		E9PAM4	449 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ACSL4	O60488	711 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CST8	O60676	142 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ABCB7	O75027	752 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	PHF2	O75151	1096 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	PAGE1	O75459	146 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	IRF1	P10914	325 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GOT1	P17174	413 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	IGFBP4	P22692	258 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	FSHR	P23945	695 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	EPHB2	P29323	1055 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CHRNA3	P32297	505 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	NR2C2	P49116	596 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ARSE	P51690	589 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RAB6C	Q53S08	254 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RFX8	Q6ZV50	586 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GPR149	Q86SP6	731 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	LZTR1	Q8N653	840 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	P3H4	Q92791	437 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MS4A14	Q96JA4	679 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RNF157	Q96PX1	679 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	SIK2	Q9H0K1	926 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CLDND1	Q9NY35	253 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GDE1	Q9NZC3	331 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	NOTCH4	Q99466	2003 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	E2F8	A0AVK6	867 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CFAP69	A5D8W1	941 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	NDC80	O14777	642 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	NCAM2	O15394	837 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	STC2	O76061	302 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	LRIG2	O94898	1065 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GAS8	O95995	478 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TCF3	P15923	654 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CEBPB	P17676	345 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MX2	P20592	715 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TACR2	P21452	398 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	WEE1	P30291	646 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	HOXC13	P31276	330 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CHKA	P35790	457 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MAPKAPK2	P49137	400 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	DYNLT1	P63172	113 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	SEMA3B	Q13214	749 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ADAM15	Q13444	863 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GRIN2C	Q14957	1233 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TEAD2	Q15562	447 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CCNG2	Q16589	344 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CA9	Q16790	459 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	C8orf74	Q6P047	294 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	AADACL2	Q6P093	401 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	TSC1	Q92574	1164 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	RUBCN	Q92622	972 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
SFI1-223	ENST00000484806	E2F7	Q96AV8	911 aa		8.31	□□□□□ -1.08

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