RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483738.1

UBIAD1-203, Transcript of UbiA prenyltransferase domain containing 1, human

TSL 3

Gene UBIAD1, Length 1,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBIAD1-203	ENST00000483738	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDC6	Q99741	560 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CACNA1G	O43497	2377 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738		M0QYV0	167 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	FLRT2	O43155	660 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	IRAK2	O43187	625 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	TBL1X	O60907	577 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	PAEP	P09466	180 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	HLA-E	P13747	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRCP	P42785	496 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	ENPP2	Q13822	863 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	GSE1	Q14687	1217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBIAD1-203	ENST00000483738	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	CAPN9	O14815	690 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FBXO21	O94952	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FSBP	O95073	299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SEMA4F	O95754	770 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	LTF	P02788	710 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ASL	P04424	464 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	RGS7	P49802	495 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	COPA	P53621	1224 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	C21orf59	P57076	290 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	TBX4	P57082	545 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	CDH18	Q13634	790 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	BECN1	Q14457	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	STIM2	Q9P246	746 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738		A0A1B0GVT2	93 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738		E7ENQ6	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	TULP2	O00295	520 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738		O00370	1275 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ACSL4	O60488	711 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	APOE	P02649	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	HLA-F	P30511	346 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	NNMT	P40261	264 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FMO5	P49326	533 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	CCT8	P50990	548 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	DAOA	P59103	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	FAM193A	P78312	1265 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	HLA-B	Q31612	363 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBIAD1-203	ENST00000483738	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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