RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.99■□□□□ 0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.6
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GUCA1CO95843 209 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH2P05091 517 aa16.96■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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