RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RING1Q06587 406 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 STX1AQ16623 288 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FOXJ1Q92949 421 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SERPINB11Q96P15 392 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GGA2Q9UJY4 613 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ACACBO00763 2458 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GIPC1O14908 333 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IRAK2O43187 625 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ACSL4O60488 711 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TBL1XO60907 577 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SERPINF2P08697 491 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ACADMP11310 421 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GNA15P30679 374 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GPD2P43304 727 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MEA1Q16626 185 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CHST9Q7L1S5 443 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CACUL1Q86Y37 369 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 AHI1Q8N157 1196 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RNF214Q8ND24 703 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FAM81BQ96LP2 452 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CAPN10Q9HC96 672 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ANO10Q9NW15 660 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CKAP5Q14008 2032 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 MEI4A8MW99 385 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 THAP12O43422 761 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 CEACAM1P13688 526 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-EP13747 358 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SLC6A4P31645 630 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 TPMTP51580 245 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 COPAP53621 1224 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 NNTQ13423 1086 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 MPP7Q5T2T1 576 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 STK32AQ8WU08 396 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 AZIN2Q96A70 460 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FRYQ5TBA9 3013 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 KCNJ18B7U540 433 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 CAPN9O14815 690 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FYNP06241 537 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SYPP08247 313 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 GNSP15586 552 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 OXTRP30559 389 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 USP8P40818 1118 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SHC2P98077 582 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms