RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 C3orf49Q96BT1 292 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 REEP2Q9BRK0 252 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 IL23AQ9NPF7 189 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ETAA1Q9NY74 926 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2QL1A1L167 161 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 AQP7P3A6NL99 342 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 DOK2O60496 412 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 PIAS2O75928 621 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS6KB1P23443 525 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NPEPPSP55786 919 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBP1BP68106 108 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FHL3Q13643 280 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP1A4Q13733 1029 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMC3Q5W041 872 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 MED25Q71SY5 747 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LGI4Q8N135 537 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FITM2Q8N6M3 262 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA1Q92805 767 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM227BQ96M60 508 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TEPSINQ96N21 525 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR20Q99678 358 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SIK2Q9H0K1 926 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 KCND3Q9UK17 655 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR34Q9UPC5 381 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 B5MCH6 92 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 PPIP5K2O43314 1243 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 AHCYL1O43865 530 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 B4GALT4O60513 344 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBED4O75132 1171 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF5LO75529 589 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 TIPRLO75663 272 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RASAL1O95294 804 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP21A2P08686 494 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 CHRM3P20309 590 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF134P52741 427 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LILRA4P59901 499 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SP3Q02447 781 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SLFN5Q08AF3 891 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 IQCB1Q15051 598 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF151Q2KHN1 245 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG16L1Q676U5 607 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SYT13Q7L8C5 426 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM124AQ86V42 546 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF169Q8NCN4 708 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RABGGTAQ92696 567 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 SDF4Q9BRK5 362 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 DERAQ9Y315 318 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.21□□□□□ -1.41
STRADBP1-201ENST00000478954 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 STX16O14662 325 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SPTLC2O15270 562 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 RAD17O75943 681 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 VIPP01282 170 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms