RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 OPHN1O60890 802 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PEX11BO96011 259 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 F11P03951 625 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CSF2RAP15509 400 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 YWHAQP27348 245 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HSD17B3P37058 310 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 USP46P62068 366 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SLC7A9P82251 487 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SLC7A5Q01650 507 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 LEMD2Q8NC56 503 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CPT1BQ92523 772 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 IL12RB2Q99665 862 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 IL21Q9HBE4 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PQH9 124 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SPAG6O75602 509 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 MMP13P45452 471 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PDK1Q15118 436 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TRADDQ15628 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CASP10Q92851 521 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF599Q96NL3 588 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 H3BNC9 293 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 ALDH1A2O94788 518 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SEC24AO95486 1093 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 C7P10643 843 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 RHOQP17081 205 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF534Q76KX8 674 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 RFX6Q8HWS3 928 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CPXM2Q8N436 756 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 P3H4Q92791 437 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 USTQ9Y2C2 406 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0A0MRY4 1105 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 A6NNZ2 444 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 VAV1P15498 845 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB6P35237 376 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 GRIK1P39086 918 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ARL4AP40617 200 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PGFP49763 221 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CSRP3P50461 194 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 GDF10P55107 478 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ERVK-21P61565 698 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MMRN1Q13201 1228 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 KRT81Q14533 505 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 KRT222Q8N1A0 295 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 LMLNQ96KR4 655 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA13Q96N96 652 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PDFQ9HBH1 243 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HCSTQ9UBK5 93 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 YIPF1Q9Y548 306 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 AP3B1O00203 1094 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PSMD3O43242 534 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 GOT1P17174 413 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MX2P20592 715 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 BMP8BP34820 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 BMPR1AP36894 532 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ITGA8P53708 1063 aa6.65□□□□□ -1.34
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