RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 B4GALT3O60512 393 aa7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 CALCAP01258 141 aa7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-207ENST00000475558 LILRA6Q6PI73 481 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 BNIPLQ7Z465 357 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-207ENST00000475558 LZTR1Q8N653 840 aa7.28□□□□□ -1.24
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