RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa30.4■■■□□ 2.46
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FBXO18-208ENST00000470089 CHRNB2P17787 502 aa30.4■■■□□ 2.46
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FBXO18-208ENST00000470089 RNF43Q68DV7 783 aa30.34■■■□□ 2.45
FBXO18-208ENST00000470089 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa30.34■■■□□ 2.45
FBXO18-208ENST00000470089 MFN1Q8IWA4 741 aa30.34■■■□□ 2.45
FBXO18-208ENST00000470089 CARNMT1Q8N4J0 409 aa30.34■■■□□ 2.45
FBXO18-208ENST00000470089 NPY6RQ99463 290 aa30.34■■■□□ 2.45
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