RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.5■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 STKLD1Q8NE28 680 aa16.5■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.5■□□□□ 0.23
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SHQ1-202ENST00000444040 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.49■□□□□ 0.23
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SHQ1-202ENST00000444040 H3BRJ5 948 aa16.48■□□□□ 0.23
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SHQ1-202ENST00000444040 RNF169Q8NCN4 708 aa16.47■□□□□ 0.23
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SHQ1-202ENST00000444040 FBXO41Q8TF61 875 aa16.47■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 SPON1Q9HCB6 807 aa16.47■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 COX16Q9P0S2 106 aa16.47■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 EMCNQ9ULC0 261 aa16.47■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.47■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SHQ1-202ENST00000444040 DCLK1O15075 740 aa16.46■□□□□ 0.23
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