RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DCAF15Q66K64 600 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ATG14Q6ZNE5 492 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF217Q8TC41 542 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 USP33Q8TEY7 942 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 AGAP2Q99490 1192 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SYBUQ9NX95 663 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A088AWK7 358 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CAPN14A8MX76 684 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM189A1O60320 539 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 RALBP11234 206 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 AP3M2P53677 418 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 IRF9Q00978 393 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF781Q8N8C0 355 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC106Q9BWC9 280 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 DCAF6Q58WW2 860 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 DPP3Q9NY33 737 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 GGA3Q9NZ52 723 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ACKR2O00590 384 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINA6P08185 405 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 P4HA1P13674 534 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CYTH1Q15438 398 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM198Q66K66 360 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 MOB2Q70IA6 237 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC30AQ86WT1 665 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 DCLK2Q8N568 766 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 OTUD5Q96G74 571 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 C7orf26Q96N11 449 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PIM2Q9P1W9 311 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PIGRP01833 764 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 HDAC4P56524 1084 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMB3Q13751 1172 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 NUF2Q9BZD4 464 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 S100A14Q9HCY8 104 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SPAG6O75602 509 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 FGFR3P22607 806 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ARRB2P32121 409 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPN7P35236 360 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TEX44Q53QW1 395 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 REPS2Q8NFH8 660 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 GATA6Q92908 595 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 OCEL1Q9H607 264 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CHRNGP07510 517 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA31D3P0C874 917 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 VDRP11473 427 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 INHBEP58166 350 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 DEUP1Q05D60 604 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 STILQ15468 1287 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 KIZQ2M2Z5 673 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 BOLA3Q53S33 107 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PACS1Q6VY07 963 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF135Q8IUD6 432 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 LHX5Q9H2C1 402 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGA2BP08514 1039 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 AKAP5P24588 427 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ARL4AP40617 200 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 IDH3AP50213 366 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GK3PQ14409 553 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SURF1Q15526 300 aa18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms