RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBR1Q16650 682 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 XKR9Q5GH70 373 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANO5Q75V66 913 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASF1Q92558 559 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAS1Q92839 578 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM143Q96AN5 459 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf76Q96K31 380 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP170P1Q96L14 293 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBOAT7Q96N66 472 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD11Q96NU1 681 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIT2Q99578 217 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOL6Q9BWW8 343 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP34Q70CQ2 3546 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MROH6A6NGR9 719 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSBPO95073 299 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 STBD1O95210 358 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAG3L1P0CL83 205 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP3A7P24462 503 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFPP27918 469 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMPR1AP36894 532 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRIP1P48552 1158 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEOX1P50221 254 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMC5P62195 406 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HYAL1Q12794 435 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN2A1Q16706 1144 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAK1Q2M2I8 961 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 XKR3Q5GH77 459 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXNQ6DKJ4 435 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT17Q6IS24 598 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C14orf80Q86SX3 495 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC14AQ86T13 490 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC43Q8N309 656 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RDM1Q8NG50 284 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 POF1BQ8WVV4 589 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRG4Q8WWG1 115 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOL5Q9BWW9 433 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS18Q9NS28 235 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH22Q9UJ99 828 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 COG5Q9UP83 839 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN1AP35498 2009 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL4A3Q01955 1670 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf67F2Z3F1 127 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PER2O15055 1255 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms