RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CRY1	Q16526	586 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	MEA1	Q16626	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FBXO43	Q4G163	708 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DEFB106A	Q8N104	65 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CPXM2	Q8N436	756 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	IQCD	Q96DY2	449 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DEC1	Q9P2X7	70 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	NCDN	Q9UBB6	729 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM131	Q92545	1883 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	AXIN1	O15169	862 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TBL1X	O60907	577 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FBXO21	O94952	628 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TPM2	P07951	284 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	GABRG2	P18507	467 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FLT3	P36888	993 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DGKE	P52429	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	COG7	P83436	770 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SPEM2	Q0P670	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CHSY1	Q86X52	802 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	EMC1	Q8N766	993 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	GAB3	Q8WWW8	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SERPINB11	Q96P15	392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	MTG2	Q9H4K7	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	STIM2	Q9P246	746 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ACSL4	O60488	711 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SOX5	P35711	763 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SULT1E1	P49888	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	AMPD2	Q01433	879 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ARID5A	Q03989	594 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	UBXN1	Q04323	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PTK2	Q05397	1052 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	LMAN2	Q12907	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF234	Q14588	700 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PLK5	Q496M5	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	DCAF6	Q58WW2	860 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FSCB	Q5H9T9	825 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	ARTN	Q5T4W7	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	RNF43	Q68DV7	783 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CEP68	Q76N32	757 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	LMLN	Q96KR4	655 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	TBCB	Q99426	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-216	ENST00000428482	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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