RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1A4Q13733 1029 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF148Q8N7C7 305 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UCMAQ8WVF2 138 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOX2Q99424 681 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SERHLQ9NQF3 203 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB21Q9UL25 225 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MRASO14807 208 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ENDOD1O94919 500 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SREBF1P36956 1147 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP12AP54707 1039 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL6P60660 151 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PHKG1Q16816 387 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIQKQ629K1 86 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCBQ99426 244 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UBP1Q9NZI7 540 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR23AA6NEV1 266 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB561D2O14569 222 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINF2P08697 491 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC2A4P14672 509 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DDR2Q16832 855 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MARC1Q5VT66 337 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKS6Q68DC2 871 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT77Q7Z794 578 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EID3Q8N140 333 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD9Q8NE22 299 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5MQ9NPB1 228 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NHSQ6T4R5 1651 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LRG1P02750 347 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SSTR1P30872 391 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH17Q12864 832 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 POU6F1Q14863 301 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK11Q15759 364 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NEDD8Q15843 81 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS28Q9UK41 221 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 AFF2P51816 1311 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A096LPK6 155 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C2CD2LO14523 706 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CCR1P32246 355 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAA2P54646 552 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOAP61586 193 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MACC1Q6ZN28 852 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK20Q8IZL9 346 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL31Q9H511 634 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 POLE3Q9NRF9 147 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 BTAF1O14981 1849 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BMM5 538 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DYRK3O43781 588 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FYNP06241 537 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms