RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 GCATO75600 419 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CIB2O75838 187 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 GABBR2O75899 941 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TM7SF2O76062 418 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 LBRQ14739 615 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A41Q8N5S1 370 aa19.25■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A8Q9UHI5 535 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX9Q9Y5X1 595 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ITM2AO43736 263 aa19.25■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 BIRC5O15392 142 aa19.24■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 TPSAB1Q15661 275 aa19.24■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM24O75264 130 aa19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF220Q5VTB9 566 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF778Q96MU6 729 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SDR42E2A6NKP2 422 aa19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 DPYSL2Q16555 572 aa19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf22Q6V702 233 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ARCQ7LC44 396 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD2Q9Y426 696 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TPP1O14773 563 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR3P61158 418 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CAP1Q01518 475 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PYROXD2Q8N2H3 581 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC185Q8N715 623 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 POU5F2Q8N7G0 328 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CSPG4P5Q96PW8 444 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP41Q9BYV8 373 aa19.22■□□□□ 0.67
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