RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 C2orf54Q08AI8 447 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NEDD9Q14511 834 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDIA5Q14554 519 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAB2Q15742 525 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HLFQ16534 295 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 IL17AQ16552 155 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC18A3Q16572 532 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTGISQ16647 500 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC142Q17RM4 750 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TTMPQ5BVD1 217 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAA35Q5VZE5 725 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDXDC1Q6P996 788 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q6ZVL8 140 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NEK8Q86SG6 692 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 VPS36Q86VN1 386 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PIGBQ92521 554 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TAF4BQ92750 862 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CENPTQ96BT3 561 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MXD3Q9BW11 206 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TLR10Q9BXR5 811 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ISCUQ9H1K1 167 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 IFT22Q9H7X7 185 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 VTA1Q9NP79 307 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRIM10Q9UDY6 481 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 INTUQ9ULD6 942 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MYH4Q9Y623 1939 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FOCADQ5VW36 1801 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PIPSLA2A3N6 862 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC78A2IDD5 438 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 C5orf60A6NFR6 353 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF233A6NK53 670 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSPY2A6NKD2 308 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LRRC53A6NM62 1247 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF263O14978 683 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAPPC3O43617 180 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SRGAP2O75044 1071 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FLOT1O75955 427 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MOCS3O95396 460 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GASTP01350 101 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GSTA1P08263 222 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAP2AP10114 183 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GHRP10912 638 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HSPA6P17066 643 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AVPR1BP47901 424 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FNTAP49354 379 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MMP14P50281 582 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 DHCR24Q15392 516 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms