RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NEU3Q9UQ49 428 aa20.84■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 NUP205Q92621 2012 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 H3BRJ5 948 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 RFXAPO00287 272 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 ECEL1O95672 775 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 ETS1P14921 441 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 GJA1P17302 382 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 NRLP54845 237 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 TPI1P60174 286 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 TMC8Q8IU68 726 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 IFT81Q8WYA0 676 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 LRRC3Q9BY71 257 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 NACA2Q9H009 215 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.83■□□□□ 0.93
ODC1-202ENST00000405333 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DAPK3O43293 454 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 LPXNO60711 386 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 IGLV3-27P01718 113 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 CLCN6P51797 869 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 GDF10P55107 478 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NOMO1Q15155 1222 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 TXNDC8Q6A555 127 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 C14orf80Q86SX3 495 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ITIH5Q86UX2 942 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ATL2Q8NHH9 583 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SAMD11Q96NU1 681 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 GKN1Q9NS71 199 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 MFSD11O43934 449 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ERCC2P18074 760 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 GABRR2P28476 465 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 VPS41P49754 854 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 CYP4F8P98187 520 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SLCO2A1Q92959 643 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 HAPLN3Q96S86 360 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ERP44Q9BS26 406 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 MSRAQ9UJ68 235 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.82■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DCLK1O15075 740 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 TGM2P21980 687 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 EPHB2P29323 1055 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R7Q15435 360 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DUPD1Q68J44 220 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 TTC13Q8NBP0 860 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 WBP2Q969T9 261 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 CORO1BQ9BR76 489 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 DTLQ9NZJ0 730 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NFU1Q9UMS0 254 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SNX24Q9Y343 169 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NOTCH4Q99466 2003 aa20.81■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 FAM187AA6NFU0 413 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 RBP3P10745 1247 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 CCR2P41597 374 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 IRAK1P51617 712 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NNTQ13423 1086 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NPWQ8N729 165 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 EPAS1Q99814 870 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ASB3Q9Y575 518 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PRU2 124 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 MCF2LO15068 1137 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ITGAVP06756 1048 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ECHS1P30084 290 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 MANEALQ5VSG8 457 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 IFT20Q8IY31 132 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ZNF276Q8N554 614 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 ALLCQ8N6M5 410 aa20.8■□□□□ 0.92
ODC1-202ENST00000405333 SEC14L1Q92503 715 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms