RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389103.4

UBE3C-202, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBE3C, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3C-202ENST00000389103 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 GGA2Q9UJY4 613 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 THADAQ6YHU6 1953 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE3C-202ENST00000389103 LNP1A1A4G5 178 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 NPC1O15118 1278 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 IRAK2O43187 625 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ZNF217O75362 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 NNTQ13423 1086 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 STARD3Q14849 445 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MPP7Q5T2T1 576 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CHST9Q7L1S5 443 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 GBP4Q96PP9 640 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 EDEM2Q9BV94 578 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 LHX5Q9H2C1 402 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 STIM2Q9P246 746 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 LAMA1P25391 3075 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 AP5Z1O43299 807 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TIMM44O43615 452 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 IGLV3-25P01717 112 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ERBB2P04626 1255 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 HLA-EP13747 358 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ITPKAP23677 461 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CD70P32970 193 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ARID5AQ03989 594 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 FAM170AA1A519 330 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 TM4SF5O14894 197 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 GRAP2O75791 330 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 EPHX1P07099 455 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 KRT9P35527 623 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 COPAP53621 1224 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 IRX4P78413 519 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PTPRNQ16849 979 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 DCAF6Q58WW2 860 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PPM1JQ5JR12 505 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MBLAC2Q68D91 279 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 IL31Q6EBC2 164 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SYT12Q8IV01 421 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 MFN1Q8IWA4 741 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 DEFB106AQ8N104 65 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 AHI1Q8N157 1196 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ZNF366Q8N895 744 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 LMLNQ96KR4 655 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 NUP205Q92621 2012 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 UCHL3P15374 230 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 ZNF33AQ06730 810 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3C-202ENST00000389103 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms