RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383904.1

RNU6-657P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 657, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-657P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-657P-201ENST00000383904 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ZNF503Q96F45 646 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 HIC2Q96JB3 615 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 C20orf173Q96LM9 149 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 MLST8Q9BVC4 326 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TMEM160Q9NX00 188 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 LINC00473A8K010 186 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 H0YIZ8 118 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TSPAN4O14817 238 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 KLK10O43240 276 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 BAIAP3O94812 1187 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 RHOBTB3O94955 611 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ZNF202O95125 648 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CYP3A4P08684 503 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 FAM163BP0C2L3 166 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CXCR5P32302 372 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DIO1P49895 249 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SOX10P56693 466 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 MPP1Q00013 466 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CFHR3Q02985 330 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 LMAN2Q12907 356 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CDSNQ15517 529 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CEP85Q6P2H3 762 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 Q6YL49 198 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ARRDC3Q96B67 414 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 HVCN1Q96D96 273 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TIGD1Q96MW7 591 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SNX18Q96RF0 628 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 MMS19Q96T76 1030 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CD180Q99467 661 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CIPCQ9C0C6 399 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 GGA3Q9NZ52 723 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 VPS4AQ9UN37 437 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 AGAP5A6NIR3 686 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 VWC2LB2RUY7 222 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 BTBD19C9JJ37 291 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SUV39H1O43463 412 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 USP12O75317 370 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 GCATO75600 419 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ERBB2P04626 1255 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ELFN1P0C7U0 828 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PRKCHP24723 683 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PCSK6P29122 969 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 GALNSP34059 522 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PAFAH1B1P43034 410 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 GPC5P78333 572 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DEUP1Q05D60 604 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ABHD18Q0P651 414 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DCTN1Q14203 1278 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 KCNB1Q14721 858 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TMEM65Q6PI78 240 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 TERB1Q8NA31 727 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 ST8SIA4Q92187 359 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 VEZTQ9HBM0 779 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 PREBQ9HCU5 417 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-657P-201ENST00000383904 FZD4Q9ULV1 537 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms