RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF398	Q8TD17	642 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	STMN2	Q93045	179 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PPCS	Q9HAB8	311 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SETD4	Q9NVD3	440 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		A8MXQ7	604 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HBP1	O60381	514 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TPH1	P17752	444 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SAT1	P21673	171 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CCNF	P41002	786 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MAGEA3	P43357	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KLC1	Q07866	573 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NME3	Q13232	169 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PCLAF	Q15004	111 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	STIL	Q15468	1287 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MBLAC2	Q68D91	279 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ARMCX2	Q7L311	632 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	OSMR	Q99650	979 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	VPS33B	Q9H267	617 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	BATF3	Q9NR55	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		A6NJR5	290 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		E9PBE3	544 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF103	O00237	685 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KLHL41	O60662	606 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TGDS	O95455	350 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MCF2	P10911	925 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CPOX	P36551	454 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RBP5	P82980	135 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ITGA9	Q13797	1035 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	BOLA3	Q53S33	107 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DCAF6	Q58WW2	860 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PACS1	Q6VY07	963 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NME8	Q8N427	588 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MAPK15	Q8TD08	544 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RTP4	Q96DX8	246 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	C7orf26	Q96N11	449 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SORT1	Q99523	831 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A088AWK7	358 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KRT38	O76015	456 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	LTF	P02788	710 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PROC	P04070	461 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ANPEP	P15144	967 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ACADS	P16219	412 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TGM2	P21980	687 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC1A6	P48664	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	GRIK3	Q13003	919 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM110	Q86TL2	294 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HPS6	Q86YV9	775 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB106A	Q8N104	65 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF148	Q8N7C7	305 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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