RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 RNF43Q68DV7 783 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM110Q86TL2 294 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB119Q8N690 84 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 EDEM2Q9BV94 578 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LHX5Q9H2C1 402 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LNP1A1A4G5 178 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A4P31645 630 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC11A2P49281 568 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KCNMA1Q12791 1236 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KRT31Q15323 416 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FUT11Q495W5 492 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC36A4Q6YBV0 504 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ADAM32Q8TC27 787 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 AZIN2Q96A70 460 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 NOX5Q96PH1 765 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM74BQ9NUR3 256 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FANCLQ9NW38 375 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 AP5Z1O43299 807 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF217O75362 1048 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 UCHL3P15374 230 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 IRX4P78413 519 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TYRO3Q06418 890 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 STARD3Q14849 445 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 NADSYN1Q6IA69 706 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TAC4Q86UU9 113 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC39A13Q96H72 371 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINB11Q96P15 392 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CEP83Q9Y592 693 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TIMM44O43615 452 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TBL1XO60907 577 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ITPKAP23677 461 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PRKCHP24723 683 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KRT9P35527 623 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PDCLQ13371 301 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CHST9Q7L1S5 443 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SYT12Q8IV01 421 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 STK33Q9BYT3 514 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 C4orf47A7E2U8 309 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CAPN9O14815 690 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CLCN1P35523 988 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 NNTQ13423 1086 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 E2F5Q15329 346 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TAF5Q15542 800 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PASD1Q8IV76 773 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 VPS16Q9H269 839 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 STIM2Q9P246 746 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 GGA2Q9UJY4 613 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 IRAK2O43187 625 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF18P17022 549 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KCNA4P22459 653 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ARID5AQ03989 594 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF33AQ06730 810 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms