RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN14A8MX76 684 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 H0YCG3 227 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CALB1P05937 261 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PYGLP06737 847 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 KRT5P13647 590 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 AOC1P19801 751 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3CAP42336 1068 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NEK3P51956 506 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CHN2P52757 468 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SULT2A1Q06520 285 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 WASHC5Q12768 1159 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 HYAL2Q12891 473 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MYBPC3Q14896 1274 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NLRX1Q86UT6 975 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF276Q8N554 614 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF576Q9H609 170 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 S100A14Q9HCY8 104 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PADI4Q9UM07 663 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 DMTF1Q9Y222 760 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 RIPK3Q9Y572 518 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SOBPA7XYQ1 873 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SGK1O00141 431 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 COPEO14579 308 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 EFSO43281 561 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 BAG2O95816 211 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA2BP08514 1039 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CD33P20138 364 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CNTFP26441 200 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ACADVLP49748 655 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TMED1Q13445 227 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PGM5Q15124 567 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MMEL1Q495T6 779 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MTERF2Q49AM1 385 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CST9Q5W186 159 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MON1BQ7L1V2 547 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP8Q86W28 1048 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MZB1Q8WU39 189 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK13Q9HB14 408 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD7Q9P203 1132 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 COL20A1Q9P218 1284 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 RAB26Q9ULW5 256 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPM1 405 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 PDHXO00330 501 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 FAM189A1O60320 539 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 KRT38O76015 456 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-201ENST00000372616 LYPLA2O95372 231 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms