RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 SERPINA4P29622 427 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 GRK5P34947 590 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 STAT6P42226 847 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 MAPK9P45984 424 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 HMGA2P52926 109 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 SHC2P98077 582 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNB1Q14721 858 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 SEC23BQ15437 767 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 CNGA3Q16281 694 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 ANKRD45Q5TZF3 282 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 RANBP10Q6VN20 620 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 GLMPQ8WWB7 406 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAR2Q96K12 515 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 COG8Q96MW5 612 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 RRN3Q9NYV6 651 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
RNU6-960P-201ENST00000364056 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRRT4C9JH25 899 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 H7C1Q1 480 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 IRAK2O43187 625 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP3A4P08684 503 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSD3B1P14060 373 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CNTFP26441 200 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 IDUAP35475 653 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 RCAN1P53805 252 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC37A1P57057 533 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CBFBQ13951 182 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 C4orf46Q504U0 113 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 WDR93Q6P2C0 686 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 RFX8Q6ZV50 586 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 LAS2Q8IYD9 372 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 PPM1EQ8WY54 764 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CPT1BQ92523 772 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 EVI5LQ96CN4 794 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 GCC1Q96CN9 775 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 GGA3Q9NZ52 723 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 NFU1Q9UMS0 254 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 TTC34A8MYJ7 566 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 BTBD19C9JJ37 291 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 STX16O14662 325 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 RRHO14718 337 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 POLBP06746 335 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 LYL1P12980 280 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 NDUFS1P28331 727 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 MPGP29372 298 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 HOXD12P35452 270 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 CDK7P50613 346 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF84P51523 738 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 PROK1P58294 105 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAS2R50P59544 299 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ACTR2P61160 394 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 TUBA4AP68366 448 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 DCTN1Q14203 1278 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-960P-201ENST00000364056 LINS1Q8NG48 757 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms