RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN26Q16670 478 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 ZNF280DQ6N043 979 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 C4orf22Q6V702 233 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-30■■■□□ 14.8
ACTB-201ENST00000331789 NUP93Q8N1F7 819 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CCNYQ8ND76 341 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 GPR152Q8TDT2 470 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CASP10Q92851 521 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 OSER1Q9NX31 292 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 EURLQ9NYK6 297 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 13.7
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ACTB-201ENST00000331789 F5H423 210 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 CDH16O75309 829 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SOAT2O75908 522 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 UPP2O95045 317 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 APRTP07741 180 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MAGEA6P43360 314 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 USP46P62068 366 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PDK1Q15118 436 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 RTP2Q5QGT7 225 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 VSTM1Q6UX27 236 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PALM2Q8IXS6 379 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ATP11CQ8NB49 1132 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 P2RY11Q96G91 374 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 RABGEF1Q9UJ41 708 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PLXNA3P51805 1871 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TRIM66O15016 1216 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 IRAK2O43187 625 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 CHN1P15882 459 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SEC24CP53992 1094 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TMED2Q15363 201 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.45■□□□□ 0.54
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ACTB-201ENST00000331789 VPS52Q8N1B4 723 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 CEP41Q9BYV8 373 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SEPT10Q9P0V9 454 aa18.45■□□□□ 0.54
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ACTB-201ENST00000331789 A0A0A0MRY4 1105 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 LRIG2O94898 1065 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ATP5DP30049 168 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MAGEA11P43364 429 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 GLUD2P49448 558 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.541e-36■■■■■ 39.6
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ACTB-201ENST00000331789 NPWQ8N729 165 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 FBF1Q8TES7 1133 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SPATA13Q96N96 652 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 EPAS1Q99814 870 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SIK2Q9H0K1 926 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 EPN3Q9H201 632 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 RNF103O00237 685 aa18.43■□□□□ 0.54
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ACTB-201ENST00000331789 PIAS1O75925 651 aa18.43■□□□□ 0.54
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ACTB-201ENST00000331789 CPB1P15086 417 aa18.43■□□□□ 0.54
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ACTB-201ENST00000331789 PHBP35232 272 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MAML1Q92585 1016 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D4O60343 1298 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 WASHC5Q12768 1159 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MON1AQ86VX9 555 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 MCUQ8NE86 351 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 TOX2Q96NM4 488 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 GMIPQ9P107 970 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-201ENST00000331789 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.43■□□□□ 0.54
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