RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC39Q96DD0 335 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 STRNO43815 780 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NR2C2P49116 596 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SULT1E1P49888 294 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA5AQ13591 1074 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SPDYAQ5MJ70 313 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 OSTM1Q86WC4 334 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF487B1APH4 448 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 DGKIO75912 1065 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 KRT38O76015 456 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 RINLQ6ZS11 566 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MFN1Q8IWA4 741 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 APPL2Q8NEU8 664 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 E2F7Q96AV8 911 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TLE6Q9H808 572 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 FZD10Q9ULW2 581 aa16.87■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CEP350Q5VT06 3117 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 FCHO1O14526 889 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CCNFP41002 786 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MATKP42679 507 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SCNN1BP51168 640 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 AP1B1Q10567 949 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 OLIG2Q13516 323 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM68Q6AZZ1 485 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NSL1Q96IY1 281 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 OLFM3Q96PB7 478 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CREB3O43889 395 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CPA2P48052 419 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf46Q6P387 395 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.86■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0A0MRY4 1105 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 KLF11O14901 512 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K13O43283 966 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC6O75061 913 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TPBGLP0DKB5 382 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GNAZP19086 355 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CALB2P22676 271 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ARL4AP40617 200 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ABL2P42684 1182 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 NME3Q13232 169 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA13Q96N96 652 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 I3L4J1 428 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GSC2O15499 205 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TREHO43280 583 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC22O60826 627 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MGAT1P26572 445 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GMPRP36959 345 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 TAF6P49848 677 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MTA1Q13330 715 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GRB14Q14449 540 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SNX17Q15036 470 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 UBXN11Q5T124 520 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CES3Q6UWW8 571 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 STRADAQ7RTN6 431 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 CCNYQ8ND76 341 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY11Q96G91 374 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 ZFATQ9P243 1243 aa16.85■□□□□ 0.29
SHQ1-201ENST00000325599 PSAT1Q9Y617 370 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms