RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 XYLT1Q86Y38 959 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NUP93Q8N1F7 819 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IL31RAQ8NI17 732 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CCT7Q99832 543 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CDH19Q9H159 772 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TMEM165Q9HC07 324 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LZTS1Q9Y250 596 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GDF10P55107 478 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SEMA5AQ13591 1074 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PRPSAP1Q14558 356 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF394Q53GI3 561 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 STEAP4Q687X5 459 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TTC30AQ86WT1 665 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HM13Q8TCT9 377 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ASB7Q9H672 318 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 A0A087WXM4 84 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ENDOD1O94919 500 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SULT2A1Q06520 285 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ARMC3Q5W041 872 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PACS1Q6VY07 963 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RAPH1Q70E73 1250 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DNERQ8NFT8 737 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 EME1Q96AY2 570 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CCDC126Q96EE4 140 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NRBF2Q96F24 287 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 VPS50Q96JG6 964 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 COPG2Q9UBF2 871 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 A0A0A0MRY4 1105 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TRIM38O00635 465 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HDAC3O15379 428 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FGFR1P11362 822 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 COL6A2P12110 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DPEP1P16444 411 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PAX3P23760 479 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ICAM3P32942 547 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IDH3AP50213 366 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NUDT2P50583 147 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AQP4P55087 323 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RBP5P82980 135 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 OGDHQ02218 1023 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TMED1Q13445 227 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BMPR2Q13873 1038 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MBLAC2Q68D91 279 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CCDC80Q76M96 950 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KBTBD6Q86V97 674 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PLD5Q8N7P1 536 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TTLL6Q8N841 843 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms